PathOSWa: on-site bemonstering en detectie van plantpathogenen in water

Beschrijving

Doel
De ontwikkeling en validering van een innovatieve detectie van één pathogene oomyceet (Oomyceta) zoals pythium of phytophthora, of één schimmel zoals fusarium (Mycota) in waterstromen in de glastuinbouw. 

Het project richt zich vooral op het ontwikkelen van een representatieve bemonstering waarmee een groot watervolume kan worden geanalyseerd en interferentie door organische stof en microbiologie wordt geminimaliseerd. Het richt zich op een geautomatiseerde en representatieve bemonstering van waterstromen op het glastuinbouwbedrijf, waarna een betrouwbaarder en gevoeligere detectie via LAMP (Loop-mediated isothermal amplification) mogelijk is. Voor de detectie worden bestaande DNA- Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) sets getoetst. De betrouwbaarheid van die LAMPS is nog onzeker in de praktijk. 

Beoogde resultaten
Innovatieve on-site methode voor bemonstering en opwerking van waterstromen waardoor een on-site representatieve- en betrouwbare detectie van schimmels kan plaatsvinden.

• Apparaat voor opwerking van monstermateriaal op het glastuinbouwbedrijf zoals door centrifuge en filtering.
• Ontwikkelde/gevalideerde LAMP-test voor detectie van een schimmel of oomycete ziekte voor gewassen onder glas, zoals fusarium, pythium of phytophthora.
• Prototype koppeling van het apparaat voor opwerking aan de LAMP detectie.

Het project bestaat uit zes werkpakketen:

1. Kennisbasis, inventarisatie en selectie van targets
2. Robuuste bemonstering
3. Experimentele validatie
4. Ontwikkeling en optimalisatie in gecontroleerde omgeving
5. Pilot implantatie en praktijktesten
6. Communicatie 

Herkomst onderzoeksvraag
Vanuit het netwerk en de ondernemersgroep Water kwam de vraag of er een meetmethode ontwikkeld kon worden voor het snel, en op het bedrijf, detecteren van pathogenen in water.

Partners & financiering
Glastuinbouw Nederland, Kennis in je Kas (KijK), Plantum NL, Sendot Research B.V., Stimuleringsbudget Emissiebeperking Glastuinbouw (Stowa), gewascoöperatie Potorchidee, Sylphium, Biotech Microibials en Topsector Tuinbouw & Uitgangsmaterialen / LVVN.